答案确实应是B，有关I wish后从句的时态问题，请参见“英语语法网”的以下文章：

《I wish 后从句用虚拟语气的三种形式》

http://www.yygrammar.com/Article/201007/1645.html

在 I wish (that)后面的宾语从句中，如果谓语动词指现在的情况，应该用过去时；如果谓语动词指过去的情况应该用过去完成时。例如：

I wish (that) I was handsome. 我希望我长得漂亮。（含义是我希望我现在长得漂亮，但实际情况是我现在长得不漂亮。）

I wish (that) I hadn't said that. 但愿我没说过那样的话。（含义但愿我过去没说过那样的话 ，但事实是我过去说过那样的话 。）

（以上例句摘自《薄冰英语惯用法词典》wish 词条）

在下面的句子中，in the past years 是表示过去时间的短语，所以从句谓语动词是表示过去的情况。因此，正确答案只能是 B，不能是 have studied：

I wish that I ______ harder in the past years.  

A. studied        B. had studied     C. was studying     D. would study